Abcam | 基因剔除Knockout(KO)驗證-確認抗體特異性

Abcam | 基因剔除Knockout(KO)驗證-確認抗體特異性

2023.02.21

基因剔除Knockout(KO)驗證確認抗體特異性

為確保抗體擁有高度特異性,透過CRISPR-Cas9基因組編輯技術使用 KO 驗證,以證實可靠的研究結果。

 

困難與解決方案

抗體是生命科學和臨床研究中最常使用的工具之一,用於研究蛋白質在各種生物途徑和疾病中的功能。

 

一個好的抗體可以表現出目標蛋白的特異性敏感性,即使在低表達的狀態也能辨識目標蛋白。然而越來越多的研究顯示,並非所有抗體都具有如此特異性,許多抗體會與脫靶蛋白交叉反應。此反應會導致實驗不可再現的問題,而這些非特異性抗體會造成浪費資源並損害科學的進展。

 

剔除(KO)驗證是一種可靠的技術,用基因剔除技術使細胞株和組織不表達目標蛋白,接著進一步測試目標抗體來確認抗體特異性。當在 KO細胞株中測試時,特異性抗體不應產生訊號,而在未剔除型 (WT) 細胞株中會產生特異性目標蛋白訊號。通過此方式,KO驗證可作為真正的陰性對照來確認抗體對目標的蛋白的特異性。

 

Abcam使用CRISPR-Cas9建立多樣的人類KO單倍體細胞庫,每株細胞也都經過Sanger 定序驗證KO,最後執行抗體驗證。KO細胞株提供來自單個等位基因KO的功能完全喪失表現型,並消除二倍體細胞模型中第二個等位基因敲除的任何掩蔽。

 

剔除驗證測試結果                    

在對的抗體進行 KO 驗證時,Abcam主要使用western blot來評估結果。以下範例為每種狀況Abcam如何處理。

 

特異性抗體

結果:預期蛋白分子量(MW)band KO 樣品中消失。

後續:通過KO驗證,保證抗體的特異性。

部分特異性抗體出現額外的band

結果:預期蛋白的MWKO樣品中消失,但額外的band出現在不同的MW處。

後續:將進行額外的研究和測試以確定額外的band

非特異性抗體-KO樣品有微弱訊號

結果:與WT相比,預期MWband仍然以較低強度存在於 KO 中。

後續步驟:將進行額外的研究和測試以確定 KO 樣本中訊號背後的原因。

非特異性抗體-KO樣品有訊號

結果:在KO樣品預期的MW仍然與WT有相同強度的訊號。

後續:從目錄中刪除該抗體,並推薦具有特異性的抗體作為替代。

非特異性抗體-KOWT樣品中均無訊號

結果:抗體無法辨識WTKO樣本中的目標band

後續:從目錄中刪除該抗體,並推薦具有特異性的抗體作為替代。

 

經剔除驗證的抗體:

當看到KO驗證標籤時,您可以相信該抗體不僅已在推薦的應用和物種中得到驗證,且其特異性已通過Abcam內部KO 驗證方法得到確認。

KO-validated antibodies完整清單

 

剔除細胞株推薦:

CRISPR-Cas9 技術的應用使Abcam能夠開發範圍廣泛的KO細胞株,進而提供可靠的抗體,為您節省時間和金錢。每個KO細胞株都經過單獨克隆挑選,通過Sanger定序驗證。

knockout cell lines完整清單

 

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